Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN25C9JDP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN25C9JDP6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN25C9JDP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN25C9JDP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN25C9JDP6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN25C9JDP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN25C9JDP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN25C9JDP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN25C9JDP6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN25C9JDP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN25C9JDP6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN25C9JDP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN25C9JDP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN25C9JDP6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN25C9JDP6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN25C9JDP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN25C9JDP6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN25C9JDP6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms