Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF879B4DU55 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF879B4DU55 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF879B4DU55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF879B4DU55 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF879B4DU55 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF879B4DU55 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF879B4DU55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF879B4DU55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF879B4DU55 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF879B4DU55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms