Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOTOA8MTQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTOA8MTQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOTOA8MTQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTOA8MTQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOTOA8MTQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOTOA8MTQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOTOA8MTQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOTOA8MTQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOTOA8MTQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTOA8MTQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOTOA8MTQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTOA8MTQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTOA8MTQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms