Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D7A6NKC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D7A6NKC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D7A6NKC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D7A6NKC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH2D7A6NKC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH2D7A6NKC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH2D7A6NKC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms