Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf118A6NHY6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf118A6NHY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf118A6NHY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf118A6NHY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf118A6NHY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf118A6NHY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf118A6NHY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf118A6NHY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf118A6NHY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms