Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC160A6NGH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC160A6NGH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC160A6NGH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC160A6NGH7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC160A6NGH7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC160A6NGH7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC160A6NGH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC160A6NGH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC160A6NGH7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC160A6NGH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC160A6NGH7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC160A6NGH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC160A6NGH7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC160A6NGH7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC160A6NGH7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC160A6NGH7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC160A6NGH7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC160A6NGH7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC160A6NGH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC160A6NGH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC160A6NGH7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC160A6NGH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms