Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF222A6NCQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF222A6NCQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF222A6NCQ9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF222A6NCQ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF222A6NCQ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF222A6NCQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF222A6NCQ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF222A6NCQ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF222A6NCQ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF222A6NCQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF222A6NCQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF222A6NCQ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF222A6NCQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms