Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM221AA4D161 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM221AA4D161 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM221AA4D161 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM221AA4D161 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM221AA4D161 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM221AA4D161 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM221AA4D161 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM221AA4D161 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM221AA4D161 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM221AA4D161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM221AA4D161 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM221AA4D161 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms