Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2D9

IGKV1D-13, Immunoglobulin kappa variable 1D-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms