Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV6-7A0A0A0MS04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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