Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms