Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms