Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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