Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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SMTNP53814 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SMTNP53814 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SMTNP53814 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMTNP53814 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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