Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms