Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms