Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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