Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms