Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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