Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms