Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCA2P51587 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRCA2P51587 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms