Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MTHFRP42898 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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