Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms