Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms