Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GTSF1Q8WW33 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GTSF1Q8WW33 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms