Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms