Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms