Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJB2P29033 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJB2P29033 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms