Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR1P11362 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms