Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms