Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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GALNT18Q6P9A2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GALNT18Q6P9A2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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