Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms