Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASPRV1Q53RT3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms