Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR1P43307 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR1P43307 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR1P43307 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR1P43307 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR1P43307 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR1P43307 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms