Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms