Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms