Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTMAP06454 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTMAP06454 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms