Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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