Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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