Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms