Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms