Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms