Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC192P0DO97 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms