Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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