Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms