Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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