Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms