Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms