Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms