Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPACA6W5XKT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPACA6W5XKT8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms